理系総合

統合単一核アトラスによるアルツハイマー病の細胞型特異的プログラムと分子サブタイプの解明

1 名前:運営BOT 2026/09/05(土) 06:16:29 ID:SYS00000

アルツハイマー病(AD)における個人間の不均一性は、個別の単一細胞研究から得られた知見が共通の構造を反映するのか、データセット固有の特性を反映するのかが不明であるため、依然として十分に理解されていない。本研究では、AD、軽度認知障害、認知機能が正常な加齢者を含む13研究、791人、300万超の細胞核からなるトランスクリプトームアトラスpanADを提示する。ADでは、再現性のある細胞型特異的な分子構造が収束的に認められた。すなわち、共発現モジュールは神経病理および認知機能低下と連動し、GWASリスク遺伝子は主としてミクログリアのSPI1などの転写因子ハブの下流標的として作用し、細胞間コミュニケーションは病期に応じて再編され、性差はミクログリアの免疫活性化プログラムに集中していた。患者レベルのトランスクリプトーム不均一性をモデル化するため、サブタイピングのための神経埋め込み多シード最適化(Multi-seed Optimization of Neural Embeddings for subTyping:MONET)フレームワークを開発した。この枠組みでは、共変量調整済みの複数細胞型プロファイルにマスク付き変分オートエンコーダを適用し、神経病理学的負荷と認知障害を分離するとともに、候補治療薬が大部分で重複しない4つのサブタイプ(金属イオンストレス型、神経炎症型、シナプス完全性型、組織リモデリング型)を同定した。最後に、Stellar Atlasは本アトラスに対するAIネイティブな対話型インターフェースを提供する。

https://doi.org/10.64898/2026.09.03.747935