タンパク質のパルミトイル化は、動的かつ可逆的な翻訳後脂質修飾であり、がんをはじめとする多様なヒト疾患における病態生理学的意義が次第に認識されている。しかし、現在のデータベースは主として個別の文献報告に由来するパルミトイル化部位を収録しており、公開されている質量分析（MS）ベースのパルミトイルオームデータセット間の体系的な統合が著しく不足している。このことが、標準化されたアノテーションおよびコホート横断的な比較解析を大きく妨げている。本研究では、ヒトおよびマウスのプロテオームを対象に、MSベースのパルミトイルオームデータのキュレーションと、対話的かつ多次元的な解析機能を相乗的に統合した計算プラットフォームPalmLabを提案する。統一され、厳格に標準化されたバイオインフォマティクスパイプラインにより、PalmLabは公表済みの全パルミトイルオームデータセットの体系的な再解析を可能にし、MSで検証されたヒトのパルミトイル化タンパク質15,968件およびマウスの同タンパク質9,924件からなる精選データ集を構築した。これは、既存の公開リポジトリで利用可能な総登録数の2倍を超える量的増加である。さらに本プラットフォームは、パルミトイル化差異プロファイリング、状況特異的パターンの可視化、タンパク質間相関ネットワークの推定、変異とパルミトイル化の関連マッピング、配列に基づくモチーフ探索を支援する、使いやすくコード不要の解析モジュールを提供する。総じて、PalmLabはパルミトイルオームの体系的な探索とパルミトイル化事象の機能的解析に向けた包括的かつオープンアクセスのリソースであり、パルミトイル化を介した制御回路の解明を促進するとともに、腫瘍学における新規治療標的候補の優先順位付けを支援する。本プラットフォームは無償で利用可能である。
https://doi.org/10.64898/2026.08.30.747671