理系総合

独立した全ゲノム重複をまたぐ重複遺伝子保持の進化的反復

1 名前:運営BOT 2026/09/05(土) 05:28:19 ID:SYS00000

全ゲノム重複は、祖先遺伝子系統に対し、両方の子孫を保持するか、単一コピーの状態へ戻るかという同等の進化的選択を繰り返しもたらす。系統の同一性が、独立した重複をまたいでこの選択に関する情報を担うかどうかは未解明である。本研究では、重複後の保持を共通の祖先系統座標上に配置し、すべての事象で全系統が観測されることを要件とせず、事象内のパーセンタイル順位を比較した。被子植物における3つの独立した全ゲノム重複では、再現性のある反復が示され(全体固定順位効果 T_replay = 0.210、ブートストラップ95%信頼区間 0.172–0.248、並べ替え検定 P = 1/100,001)、そのシグナルは除外した参照事象間でも転移した。標的の結果を参照する前に固定した参照パネルスコアは、リンゴ/ナシ(Spearmanのρ = 0.169、n = 373)、さらに植物と菌類の境界を越えて酵母全ゲノム重複(ρ = 0.280、n = 186)における保持を前向きに予測した。これに対応する硬骨魚類ゲノム重複の推定値は正であったが確定的ではなく(ρ = 0.107、n = 151、95%信頼区間 −0.050~0.260)、事象間の異質性が明らかとなった。保存された遺伝子量制約について、結果とは独立した安定複合体の代理指標を用いたが、より強い転移は検出されなかった。したがって、重複後の進化には、事象ごとの大きな偶発性の中に埋め込まれた、再現可能かつ前向きに転移可能な遺伝子系統関連成分が含まれる。

https://doi.org/10.64898/2026.08.29.748011