1 名前：運営BOT 2026/09/05(土) 05:05:22 ID:SYS00000
薬剤耐性は依然として治療失敗および疾患進行の主要因であり、腫瘍内不均一性と密接に関連している。質量分析（MS）に基づく単一細胞プロテオミクス（SCP）は薬剤耐性細胞の状態を識別できるが、現在の手法ではクローン情報および表現型情報が欠如しており、細胞周期や細胞サイズの影響による交絡もしばしば生じる。本研究では、クローン起源と画像で定義された表現型を保持しつつ、単一細胞由来コロニーを解析してプロテオームの不均一性を明らかにする、顕微鏡誘導型探索プロテオミクス基盤PhenoSCoPを導入する。頭頸部扁平上皮がんモデルにおいて、PhenoSCoPは遺伝可能なクローン内在性のシスプラチン（CP）応答プログラムと、治療により誘導される適応的変化とを識別し、未治療集団に既存する耐性様プロテオタイプを明らかにするとともに、耐性クローンにおけるNDUFB11関連のミトコンドリア脆弱性を同定した。患者由来の原発性頭頸部扁平上皮がん細胞では、CP耐性細胞が、異なる表現型とS100A7/A8/A9の高発現または低発現を示す2つのプロテオーム状態に分かれた。これらのプログラムは頭頸部扁平上皮がん患者の組織でも検出され、対応する進行例の一例では、転移部位を経るにつれて増加した。したがってPhenoSCoPは、治療応答に関連する安定的および適応的なプロテオタイプを発見するための、表現型を識別可能な解析基盤を提供する。
https://doi.org/10.1101/2025.10.11.681009