アンビセンス転写が明らかにするコンパクトな環状RNAサテライトウイルスの潜在的コード能力

環状RNAレプリコンは、コンパクトで高度に自己相補的なゲノムを共有しており、ゲノム構成とコード能力に厳しい制約が課されている。近年の研究により、このようなレプリコンには幅広い多様性が存在することが明らかになったが、その転写戦略とコード戦略は、依然として主に配列解析から推定されている。本研究では、マイナス鎖環状RNAサテライトウイルスとして記載されてきた一部のコルミオウイルス（コルミオウイルス科）が、コード能力を拡張するためにアンビセンス転写を利用することを実験的に示す。Serinus canariaコルミオウイルス（scKoV）のヘルパーウイルスとして鳥ボルナウイルスを同定し、アンビセンス転写が、これまで認識されていなかった遺伝子であるオープンリーディングフレーム2（ORF2）の発現を駆動し、それがヘルパー依存的な伝播を促進することを示す。比較解析により、ほかのコルミオウイルス系統にもアンビセンス遺伝子発現が認められ、進化の過程で独立に獲得されたことが示唆された。これらの知見は、ゲノムに強い制約を受ける環状RNAレプリコンが、アンビセンス転写を通じて追加のタンパク質コード遺伝子を獲得し得ることを示す実験的証拠となる。

https://doi.org/10.1101/2025.01.08.631871