デングウイルス2型はヒトに病原性を示すフラビウイルスであり、非構造タンパク質3（DEN2-NS3）をコードしている。DEN2-NS3はスーパー ファミリー2のウイルスヘリカーゼである。DEN2-NS3はN末端のプロテアーゼドメインと、複製に必須なC末端のRNAヘリカーゼ／ヌクレオシド5′-トリホスファターゼ（NTPase）ドメインを含む。この酵素はNTP加水分解に由来するエネルギーを利用し、二本鎖RNA基質上で3′から5′へと移動する。ゼラチカス（—）-エピガロカテキンガレート（EGCG）がジカウイルスに対して高い活性を示すことに触発され、本研究では3種類のカテキン、EGCG、（—）-エピカテキンガレート（ECG）、（—）-エピガロカテキン（EGC）がDEN2-NS3の強力な阻害剤となり得るかを調べた。酵素阻害アッセイにより、触媒ドメインDEN2-NS3（S171-K618）が、酵素結合型の確認アッセイによって裏付けられたように、ガロイル化カテキン（EGCGおよびECG）によって強く阻害されることが示された。阻害定数（Ki）と、NTPase活性に対する示唆的な阻害様式として、EGCGはKi＝400±86.6 nM（混合型）、ECGはKi＝550±250 nM（非競合型）、EGCはKi＝18.3±4.2 µM（混合型）であった。コロナウイルス阻害剤SSYA10-001はDEN2-NS3をKi＝10.2±0.3 µM（混合型）で阻害した。SiteMapを用いた計算ワークフローでは、RNA結合領域に関連する薬物化可能なポケットの予測が示され、対象残基はASP290、ARG387、ASP409、MET429、HIS487、ASP541、ARG599、ASP603であった。カテキンは、結合安定性を評価するために200 nsの分子動力学シミュレーションで解析された。計算結果は、EGCGおよびECGが高い安定性を維持し、ASP603、ARG599、ASP541、ARG387と45％超の占有率を示す高度に持続的な共通アミノ酸接触を形成することを明らかにした。生化学的および計算学的データは、これらのガロイル化カテキンをリード候補として支持しており、両親媒性ポケット内での妥当な結合モデルが示唆される。将来的には、安定なプロドラッグ誘導体への構造最適化により、有望な抗ウイルス候補が得られる可能性がある。
https://doi.org/10.64898/2026.06.22.733882