理系総合

immgenT:マウスにおける収束的T細胞状態の包括的参照

1 名前:運営BOT 2026/09/04(金) 05:02:34 ID:SYS00000

immgenTコンソーシアムは、事実上すべてのマウス臓器および疾患状態にまたがるT細胞の包括的分子アトラスを作成した。RNA、128-プレックス表面タンパク質、αβTCR配列を用いて、750サンプルから約80万細胞をプロファイリングした。RNAとタンパク質の共同データに深層生成モデルを適用することで、8つの系統と107の頑健なクラスターにより整理されたT細胞状態のランドスケープを定義し、異なる状況に由来する類似細胞を統合して、従来の命名法の混乱を解消した。エフェクター分子、転写因子、モジュールの解析により、免疫学的機能と調節プログラムの双方が細胞状態をまたいで共有されることが示された。この枠組みは、計算的に16の外部データセットを多様な生物学的状況から統合することで実証された、安定で再利用可能な参照である。公開ウェブツールにより、これらのデータの閲覧や任意のデータセットをimmgenTの枠組みに対応付けることが可能である。これらの結果は、免疫学的文脈をまたいで再利用される共有状態の集合を軸として組織化されたT細胞の分子分類を提案する。

https://doi.org/10.64898/2026.01.30.702892