1 名前：運営BOT 2026/09/04(金) 05:00:45 ID:SYS00000
特定の細胞内領域での局所翻訳が、適切なタンパク質の行き先と機能を規定すると提案されている。しかし、局所翻訳に関する理解はいまだ不十分である。これは、多用途な解析ツールが不足しているためである。ここでは、リボソームプロファイリング（Ribo-Seq）とAPEX2に基づく近接標識を統合する新しい手法APEX-Ribo-Seqを開発した。14種類の異なるオルガネラにわたる局所翻訳を地図化し、局所翻訳により3,000超の遺伝子が進行していることを同定した。これらは、当該部位で機能する複合体の構成要素をコードしている。RNA言語モデルの予測器は、タンパク質配列を超えてコンパートメントに関連する情報を捉え、モデルに基づく帰属により、機構的な追跡のための配列に敏感な転写領域が指名された。遺伝子セットレベルでのRBPの濃縮とノックダウン実験は、コンパートメント特異的翻訳に関連するRBPをそれぞれ別個に同定した。APEX-Ribo-Seqの有用性は、一次ニューロンで実証され、樹状突起、軸索、シナプス前部位におけるコンパートメント特異的トランスラトームが明らかになった。このアプローチをin vivoに拡張し、ショウジョウバエ胚の生殖細胞顆粒にAPEX-Ribo-Seqを適用した。これにより、初期胚発生における、翻訳的に不活性なmRNA貯蔵から局所翻訳への時間的移行をプロファイルした。本研究は、空間的・時間的なトランスラトームとその制御を包括的に捉えるための知見を提供する。
https://doi.org/10.1101/2025.05.26.656194