SysBio FAIRplexは、連合モデルを通じてAccelerating Medicines Partnership®（AMP®）プログラムからのデータをカタログ化し索引化するCommon Fund Venture Programである。この連合モデルでは、データホストが自らのデータセットを管理する。 本研究の中心となる要素は、SysBio Common Data Model（SysBio CDM）である。 AMPは2014年に開始された、競争以前の段階に位置づけられる官民パートナーシップであり、NIHと民間のパートナーの資源を統合し、疾患経路の理解を深め、現在の治療開発モデルを変革することを目的としている。具体的には、以下により行う。 - 新たなターゲット、バイオマーカー、開発パラダイムを同定すること； - 最先端のツールと技術を開発すること； - 大規模データセットを収集し、公衆によるオープンな解析を支援すること； - コンセンサスに基づくプラットフォームと手順を生成すること。 多分野にわたるタスクフォースが、-omics領域に向けてObservational Medical Outcomes Partnership（OMOP）Common Data Modelを拡張することにより、SysBio CDMを設計するために組織された。タスクフォースは、9つのOMOPテーブルから成るMinimum Viable Productを作成し、さらにアッセイおよびファイルメタデータのための4つの拡張テーブルと、フィールドの意味論を規定するCommon Data Element（CDE）Registryを作成した。 本稿は、提供物について記述する。すなわち、拡張テーブルを選択し構築する際に適用された基準、拡張されたモデルがAMPプロジェクト間でのマルチモーダルデータ統合をどのように支えるか、加えて追加の-omicsモダリティを支援するためにどのような追加作業が必要になるか、である。 補助的な方法論として、本論文はモデルを設定するために使用するAI支援型CDEハーモナイゼーションワークフローについても述べる。
https://doi.org/10.64898/2026.08.31.26361831