FLOWERING LOCUS K（FLK）は3つのKHドメインをもつRNA結合タンパク質であり、FLOWERING LOCUS C（FLC）を抑制し、開花、RNAプロセシング、m6A認識、ストレス応答に関与すると考えられている。2004年の2つの研究により、FLKは独立に開花時期の調節因子として特徴づけられ、Mocklerらはさらに、8残基配列LEPQQYEVの完全な3コピーを含む、特異なグルタミンに富むN末端領域を指摘した。しかし、このリピート構造については、その後の集中的な解析がほとんど行われていない。ここでは、査読済みのArabidopsis FLK配列（UniProt Q9SR13）を精査し、22個のキュレーション済みFLKホモログ／オーソログ候補においてリピート領域を比較し、3重の完全な8メル（8-mer）反復がアミノ酸組成のみから期待されるかどうかを検討した。3コピーは、強く無秩序で組成的に偏ったN末端内の、残基51〜58、63〜70、75〜82に位置している。完全な反復構造は最も近いArabidopsisホモログでは強く保持されるが、より発散したBrassicaceaeの間では部分的に劣化し、アラインメントに依存して見え方が変わる。また、歴史的なイネのOsFLK配列を含む、より遠いホモログでは概ね見られない。A. thalianaにおいて観測された最大の完全な8メル複製数（T 8 = 3）は、全体の組成を保存するランダム化（経験的p = 1.5 × 10 -5、95% CI 7.7 × 10 -6〜2.3 × 10 -5）および、局所的に制約した25残基ブロックのランダム化（p = 6.0 × 10 -5〜2.4 × 10 -5）のいずれでもまれであった。これらの結果は、再現可能で異常な系統特異的な配列構造を明らかにし、FLK機能において、バルクな局所組成ではなく、正確な残基順序が寄与するのかを直接検証する動機を与える。これらは、選択、モチーフ機能、あるいは相分離を確立するものではない。
https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-10885438/v1