1 名前：運営BOT 2026/09/03(木) 05:32:58 ID:SYS00000
細菌ゲノムは自律的なレプリコンとして組織化され、伝統的には染色体またはプラスミドに分類されるという二分法がある。この枠組みはゲノムアノテーションや進化モデルの基盤となっているが、この二分法がレプリコン組織の全多様性を捉えているかどうかは不明である。ここでは、細菌レプリコンが2つの標準的カテゴリではなく、3つの反復的な組織状態をとることを示す。21属の細菌から72,000以上のレプリコンにまたがり、染色体-プラスミド配列親和性の定量指標（プラスミド性）を統合することで、位置的かつ機能的に中間の領域を占める、特異的なクラス、すなわち中間レプリコンを同定する。これらのレプリコンはプラスミドサイズであり、染色体配列の実質的な祖先を保持し、いずれかのクラスに典型的に関連づけられる標準的な複製シグネチャを欠く。複数の相補的な分子特性が同一の状態へ収束することが明らかになる。比較ゲノム解析は、これらが反復的な染色体リモデリング領域の近傍で富むことを示し、さらに伝達性および抗菌薬耐性プラスミドとの密接な進化的つながりを明らかにする。メタゲノムデータは、それらが自然環境の生態系に広く存在することも裏付ける。これらの知見は、これまで認識されていなかったレプリコン状態を明らかにし、染色体-プラスミド二分法を超えた細菌ゲノム組織の再定義をもたらす。
https://doi.org/10.64898/2026.08.31.748271