コウモリは例外的なコロナウイルス多様性を保持し、複数のヒト病原体の祖先的な起源と考えられている。SARS-CoV-2がヒトにおけるパンデミックの出現から世界的な風土病化へ移行するにつれて、懸念は野生動物からヒトへのスピルオーバーから、逆スピルオーバー、すなわち逆獣種間伝播（reverse zoonosis）へと移っている。しかし、自然条件下で放し飼いのコウモリ集団における感染が先行研究として示されたことはなかった。ここでは、南エクアドルのアンデスおよびアマゾンの生態系にまたがり採取した野生の新熱帯コウモリにおいて、SARS-CoV-2 RNAの広範な検出を報告する。9つの分類群を含む126個体を対象としたRT-qPCRスクリーニングにより、複数の地点でコウモリの34.12%にSARS-CoV-2 RNAが検出された。5個体から部分的からほぼ完全なウイルスゲノムを回収したところ、現行のヒトSARS-CoV-2系統に対して>99%のヌクレオチド同一性を示し、複数の世界的な系統発生クレード内にまとまった。混合効果モデリングでは、種レベルで顕著な異質性が示され、標高と感染確率の間に正の関連があり、感染確率は男性よりも女性で高かった。コウモリ由来ゲノムが循環するヒト変異株に対して非常に近縁であり、かつ複数の系統にまたがって分布していることは、コウモリ特異的な持続的循環ではなく、反復的な人為的スピルバックを示唆する。これらの結果はCOVID-19パンデミックの生態学的フットプリントに関する理解を拡張し、新興感染症に対する長期的なOne Health戦略へ野生動物サーベイランスを統合することの重要性を強調する。
https://doi.org/10.64898/2026.08.27.741511