目的：ルーチンのH&E画像から定量化した核形態が、膠芽腫（GBM）の生物学および予後のバイオマーカーとして利用できるかを調べる。方法：核の偏心度、円形度、密度、異質性を、TCGA-GBMコホートにおけるH&E全スライド画像から測定し、CPTAC-GBMコホートで独立に検証した。多変量Coxモデルを両コホートで生存との関連の検定に用い、TCGAにおいてトランスクリプトーム全域解析および遺伝子セット富化解析を行い、CPTACのRNAおよびプロテオミクスデータで検証した。結果：TCGA-GBMでは、核偏心度が高いほど生存が良好であった（HR 0.85；95% CI, 0.71–1.02；P=0.089）。この好ましい関連はCPTAC-GBMでも独立に観察された（HR 0.74；95% CI, 0.60–0.90；P=0.003）。TCGAコホートでは、偏心度と個々の遺伝子の関連は統計学的に有意ではなかったが、経路解析により、上皮間葉転換（EMT）、炎症、低酸素、ストレス関連プログラムとの関連が示された。TCGA RNA、CPTAC RNA、プロテオームデータセット全体において、偏心度が高いことは一貫してNF-κBシグナル伝達の増加、コラーゲン生合成、ERからゴルジへの輸送の増加と関連し、L1CAM関連および神経投射プログラムの低下と関連していた。EMTはコホート間の整合性が最も強かった。結論：患者のH&Eスライド画像から得られる核偏心度は、GBMの生存に関連する潜在的バイオマーカーであり、転写および翻訳のプログラムとも関連する。定量病理とRNAおよびプロテオミクスデータを統合することで、GBMの予後評価と腫瘍生物学の特徴付けに対し、アクセス可能なアプローチを提供できる可能性がある。
https://doi.org/10.20944/preprints202609.0065.v1