普通ダイズ豆（Phaseolus vulgaris L.）は世界で最も広く消費されるマメ科穀物であり、有機栽培や低投入農業の基盤となる種である。しかし、そのアグロエコロジー上の価値は窒素固定や栄養供給の範囲を大きく超える。この総説は、P. vulgaris を収量だけで定義するのではなく、生態系機能によって定義される育種対象として再構成し、生物学的機能、（生物学的）窒素固定、根圏微生物叢の形成、土壌生態系の工学（エンジニアリング）に関する証拠を統合して、生態系志向型の育種プログラムが選抜すべき形質複合を特定する。有機的な管理のもとでこれらの形質の発現を制限する要因、すなわち雑草競合、生物的・非生物的ストレス、養分制限、低投入環境に適応した栽培品種および認証種子の不足を検討し、精密農業、表現型解析（フェノミクス）、分子育種、ゲノム編集、微生物叢工学といった新たな技術を含む、農生態学的な管理実践、資源利用効率の指標、そして遺伝的改良を加速しうる方法を評価する。この統合の中心には、育種目的のパラダイム転換がある。普通ダイズ豆は、植物と微生物叢の相互作用が協調して成立することで性能が生じるホロバイオントとして概念化される。したがって育種プログラムは、窒素固定効率、根系の形態（アーキテクチャ）、根圏への集菌（リクルート）能力、養分利用効率、多重ストレス耐性を、遺伝可能な生態系志向の形質として明示的に選抜する必要がある。最後に、ゲノミクス、フェノミクス、環境表現型（エンバイロタイピング）、根圏生態学を統合する優先的な育種研究の方向性を提示し、再生型で気候に賢い有機農業への移行に向けた戦略的レバーとして普通ダイズ豆育種を位置づける。
https://doi.org/10.20944/preprints202609.0047.v1