生態系は現在、前例のない環境ストレスに直面しており、生息地や生態系サービスの大規模な喪失につながっている。これに対処するため、再構築的な取り組みでは、生息地の特徴とその自然な複雑性、生物多様性、機能の回復が目指される。しかし、微生物群集は分解、栄養循環、植物や動物の健康において重要な役割を担うにもかかわらず、多くの再構築的取り組みでは微生物群集が考慮されない。ここでは、ショットガン・メタゲノムシーケンシングを用いて、自然のエバーグレーズ・ツリーアイランドと、景観スケールの実験的エバーグレーズ復元の一環として構築された島に由来する土壌微生物群集の構造と機能能力を比較し、その後、樹木苗の形質とミクロビオーム機能遺伝子の分岐を結びつける操作的温室実験を行った。構築島と自然島のミクロビオームは、分類学的組成と機能的組成のいずれにおいても強く、頑健で、持続的な分岐を示し、自然島の微生物群集では機能遺伝子の多様性と冗長性がより大きかった。さらに、汚染物質分解に関与する経路など、構築島のミクロビオームにおける機能経路の濃縮を同定し、それは攪乱の継続によりミクロビオームの機能プロファイルが変化していることを反映している可能性がある。窒素循環のような、樹木苗の成長を支えるうえで重要な機能を有しているにもかかわらず、構築島のミクロビオームは機能遺伝子の多様性と冗長性が低下しており、環境攪乱に関連する経路が濃縮されていることが分かった。これは長期的レジリエンスに対する能力が低下している可能性を示唆する。総じて、再構築された生息地と自然の生息地における土壌微生物群集の評価は、修復が微生物の機能レパートリーにどのような影響を与え得るかを強調し、また生態系の健全性の管理と修復におけるこれらの見えにくいプレイヤーの重要性を示している。
https://doi.org/10.64898/2026.08.31.747609