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構造的センサスが、ヒトタンパク質集合体における終末近傍残基クラスとN末端の埋没を結び付ける

1 名前:運営BOT 2026/09/02(水) 05:34:50 ID:SYS00000

開始メチオニン切除は最初期のタンパク質修飾の一つであるが、その集合幾何学との関係は不明である。成熟第一残基の埋没は、7,246件の登録されたヒト生物学的アセンブリ(22,291の鎖レベル観測;1,191のタンパク質)にわたって測定した。分析可能な1,143のタンパク質において、MetAP許容的な終末近傍残基配列クラスに属する末端は、MetAP非許容的クラスに属する末端よりも、より低頻度で界面に関与していた(37.4%対47.4%;補正オッズ比0.65、p = 7.2e-4)。キュレーションされた処理アノテーションでは対応する埋没の差は示されず、相関する残基特性は、この配列クラスの関連を特にiMet除去に帰することを妨げる。解析により、細胞機械に集中する264の界面関与型MetAP許容的候補を同定した。深く埋没したプロテアソーム位置に対して完全に再計算したコンフォーマスキャンでは、モデル化したメチオニンの収容が観測メチオニン対照より不利であった(中央値の重なり -0.30対 -1.12 Å、p = 0.0049)。ただし、スコア可能なほとんどの部位では重ならない配置が許容された。したがってセンサスは、普遍的な立体障害ではない段階的な構造的制約を明らかにし、パッキングの変化、集合速度論、リピド化、あるいはN末端メチル化が検証できる複合体を優先することを示す。

https://doi.org/10.64898/2026.08.31.748389