1 名前：運営BOT 2026/09/02(水) 05:28:23 ID:SYS00000
細菌のゲノムワイド関連解析（GWAS）は、配列決定された分離株群で測定される形質の遺伝的基盤を同定するための強力なアプローチである。配列決定された分離株数の増加に伴い、GWAS の限界要因は統計的検出力を得るのに十分な数の分離株を対象とするフェノタイピングになっている。大規模なフェノタイピングの必要性を克服するために、ベイズ適応型実験計画と疎な回帰モデルを結合し、表現型検査のために最大限情報量の大きい分離株を選択するベイズ適応型逐次サンプリング GWAS（BASS-GWAS）を開発した。BASS-GWAS は、ランダムサンプリングよりも多くのフェノタイピング分離株を要せずに、Neisseria gonorrhoeae における 3 つの抗菌薬耐性形質で因果的な座位を効率的に回復した。BASS-GWAS を適用して、新規トポイソメラーゼ阻害薬ゾリフロダシンおよびゲポチダシンに対する gyrB D429N 依存的交差耐性を可能にする変異を探索した。30 未満の分離株をフェノタイピングした後に、parC D86N と gyrA-parE に基づく経路の両方を同定し、その後に検証した。BASS-GWAS は、効率的な細菌 GWAS に対する実用的かつ統計的に原理に基づいた解決策を提供する。
https://doi.org/10.64898/2026.08.26.747358