背景 カルガリー・ヘルスゾーン（CHZ, カナダ）の集団ベースのコホートを用い、5つの主要病原体について縦断的な抗菌薬感受性および処方データを全ゲノム配列と統合した。抗菌薬耐性（AMR）が処方の変化にどのように応答するか、またこの動態を形作る細菌株を特定することを目的とした。方法 CHZにおける2006〜2022年の菌血症エピソードに関連する、Staphylococcus aureus 7,271株、Enterococcus faecalis 1,609株、Enterococcus faecium 801株、Escherichia coli 11,363株、Klebsiella pneumoniae 2,319株について、抗菌薬処方率、臨床データおよびゲノムデータを解析した。ゲノムクラスター（株として記述）をStrainGSTで同定し、既知のシーケンスタイプ（ST）またはクローン複合体（CC）に割り当てた。株レベルの発生率を、市中発症（入院後48時間以内に採取された分離株）と院内発症（入院後48時間超）に層別し、AMR表現型と処方率とともに、負の二項回帰および二項回帰を用いてモデル化した。時間的トレンドは平均年間パーセント変化（AAPC）で定量した。結果 2010〜2022年にかけて、フルオロキノロンの処方は市中および院内の両方で減少した（市中：AAPC=-6.8% [95% CI -8.1, -5.4]、p<0.0001；院内：AAPC=-5.1% [-6.5, -3.7]、p<0.0001）。この変化は、グラム陽性菌におけるフルオロキノロン耐性の有意な低下を伴っていた。具体的には、臨床的に重要な抗菌薬であるクロキサシリン、シプロフロキサシン、エリスロマイシン、クリンダマイシンに耐性なS. aureus菌血症は、2006〜2022年にかけて減少し、主に院内発症例で顕著であった（AAPC=-16.0%、[-19.3%, -12.7%]、p<0.0001）。E. coliでは、セフトリアキソンおよびシプロフロキサシン耐性がST131および新たに出現しているST1193に集約されていた。後者は市中発症例で特に増加し続けた（AAPC=17.7% [0.0%, 30.0%]、p<0.0001）。CTX-M-27産生E. coli ST131株は2008〜2022年の間に増加していた（AAPC=23.8% [17.4%, 30.5%]、p<0.0001）。一方で、CTX-M-14産生E. coli ST131株は2013〜2022年の間に減少していた（AAPC=-15.9% [-21.3%, -10.2%]、p<0.0001）。これらのトレンドは、2010〜2022年にかけての市中セファロスポリン処方の増加（AAPC=7.3% [4.2%, 10.5%]、p<0.0001）と連動していた。K. pneumoniaeでは、超高病原性ST23が最も多く（N=88）、2006〜2019年にかけて発生の増加傾向がみられた（AAPC=3.0% [-2.8%, 9.2%]）。結論 グラム陽性菌とグラム陰性菌でみられた耐性の対照的なトレンドは、AMR制御の取り組みの複雑さを示している。有効な戦略には、多剤クラスを標的とするスチュワードシップ、出現する耐性株に対するゲノムサーベイランス、さらに病院の枠を超える介入が必要となる。
https://doi.org/10.64898/2026.08.27.26361471