リジンアシル化（ラクチル化を含む、Klac）は細胞生理の重要な制御因子である。しかし現在、その解析は抗体によるエンリッチメント戦略によってボトルネック化されており、この方法は配列バイアスの影響を受け、ミリグラム規模のタンパク質入力を必要とするため、乏しい臨床バイオプシーや希少な細胞集団のプロファイリングを強く制限している。ここでは、acyl-NHS化学に基づく誘導体化戦略であるChemIntelligenceを提示する。この手法は、独自のアシル化特異的スペクトルライブラリを迅速に生成し、2.5×10^9を超えるヒトKlacペプチドといった例により実証され、種をまたぐ参照アトラスを可能にする。Prositに基づく再スコアリングと統合することで、これらのライブラリは多様なプロテオームデータセットにおけるKlac同定を大きく向上させる。さらに、このスペクトル資源を活用して、再現可能なマルチプレックス並列反応モニタリング（PRM）プラットフォームであるChemIntelligence Scopeを設計し、細胞ライセート約200 ngという少量から、臨床バイオプシー、さらには真の単一細胞に至るまで、1回の注入あたり数百のKlacペプチドを定量する。これにより、従来法では到達できない機能的Klacシグネチャを明らかにする。ChemIntelligenceのパイプラインは、リジンニコチル化にもシームレスに拡張でき、これが新規アシル化の探索とプロファイリングに対して広い適応性を示すことを裏づける。これらの化学的および計算的進歩により、入力制約を克服し、そうでなければ解析困難な生物学的試料から深い機能的洞察を可能にする、スケーラブルで抗体不要のアシルプロテオームマッピング基盤が確立された。
https://doi.org/10.64898/2026.08.28.746934