理系総合

DeepTrack バーコーディングによる哺乳類発生の in vivo 多モーダル 系譜追跡

1 名前:運営BOT 2026/09/02(水) 05:09:43 ID:SYS00000

発生生物学において、細胞運命の遷移とその背後にある分子変化を包括的に記録することは基本的な目標である。ここでは、in situ の細胞バーコーディングと高スループットの単一細胞マルチオミクスを統合する系譜追跡マウスモデルである DeepTrack を提案する。DeepTrack を用いて、原腸形成および初期器官形成期におけるクローンのふるまいをプロファイルし、エピブラストクローン内における初期運命プライミングを明らかにし、神経系の異なる領域におけるクローンの構築(clonal architecture)を示した。単一細胞解像度で胚全体に対して行う多オミクス 系譜追跡により、神経中胚葉前駆細胞(NMPs)における運命決定の転写プログラムとエピジェネティックプログラムを明らかにした。多オミクスプロファイルを伴うクローン追跡を可能にすることで、運命に関連する遺伝子制御ネットワークの推論を行い、NMPs における中胚葉系譜指定の主要な調節因子として転写因子 Cdx2 を同定した。キメラ胚において Cdx2 を遺伝学的に攪乱すると、傍軸中胚葉の分化が損なわれた。以上より、DeepTrack は多様な発生コンテキストにまたがる細胞運命の多モーダル制御を解読するための汎用的な枠組みを提供する。

https://doi.org/10.64898/2026.08.29.748052