オイルヤシ（Elaeis）は世界の主要な植物油の供給源である。Elaeis の種間雑種は、2つの異なるサブゲノムを1つの核へ統合することで顕著な雑種強勢を示し、その結果、アフリカオイルヤシ（E. guineensis）の高い収量と、アメリカオイルヤシ（E. oleifera）の高い不飽和脂肪酸含量および耐病性を効果的に組み合わせる。しかし、雑種強勢の遺伝的基盤は依然として不明である。ここでは、相分離したゲノムアセンブリ、比較ゲノミクス、進化ゲノミクス、ハプロタイプに配慮したトランスクリプトーム解析を統合し、交雑オイルヤシにおける雑種強勢の遺伝的構成要素を解明する。高いヘテロ接合性をもつ F1 ゲノム（『Reyou 40』、ヘテロ接合性 3.75%）を、完全な 1.73 Gb の T2T ハプロタイプ（HapG）および 1.84 Gb の near-T2T ハプロタイプ（HapO、17 個のギャップ）として構築する。配列同一性は 91.56% に達するにもかかわらず、HapG と HapO は LTR-RT の出現および PAV の影響を受ける遺伝子で分岐しており、それぞれ脂質代謝とストレス応答において補完的な偏りを示す。進化ゲノミクスにより、古代の WGDs がヤシ科を保存していることが明らかになった。一方で、オイルヤシにおける系統特異的な脂質関連遺伝子の拡張が観察される。さらに、HapG に含まれる約 64 Mb の 6 つの古代に由来する導入領域は、転移因子およびタンデム重複によって再形成され、耐性および脂質代謝に関連する遺伝子の濃縮が見られる。トランスクリプトーム解析では、アレル対遺伝子の 82.2% が平衡化した発現を維持しており、その様相は、親の機能的相補性および用量バッファリングを伴う。これらは、交雑ゲノムにおける親の遺伝的差異の調整を支える潜在的な制御基盤を示唆する。ハプロタイプ解像度に基づくこれらのゲノム資源は、雑種強勢の理解とオイルヤシ分子育種の加速に向けた重要な標的を提供する。
https://doi.org/10.64898/2026.08.27.747553