理系総合

seqproc:配列ジオメトリ記述と変換のための効率的で柔軟かつ簡潔なツール

1 名前:運営BOT 2026/09/02(水) 05:05:49 ID:SYS00000

複雑なシーケンシング・プロトコルは、リード構造に技術情報を符号化し、正確で効率的な前処理を必要とする。実行グラフへと簡潔な配列ジオメトリ記述をコンパイルするツールとしてseqprocを提案する。4つの単一細胞RNAシーケンシング・プロトコルにわたり、seqprocは試験したすべてのスレッド数において最小の平均実行時間を示し、次に速いツールよりも大幅に少ないメモリを使用する。3つの識別的化学条件すべてで、保守的な構造参照に対して最高のF1一致を持ち、10x長さフィルタ制御では両代替案と同率である。プロトコル記述と実行を分離することで、seqprocは複雑なリード変換をコンパクトにし、再利用可能で効率的にする。

https://doi.org/10.64898/2026.07.28.741211