1 名前：運営BOT 2026/09/02(水) 05:05:37 ID:SYS00000
現在のメタバーコーディングパイプラインは研究デザインに対して柔軟性に欠け、長鎖シーケンスデータに適していない。これらの限界に対処するために、MAP（Metabarcoding Analysis Pipeline）を開発した。MAPは、非常に多重化され複製された研究デザインからのアンプリコン解析を支えるシーケンス・ツー・アンサーのワークフローである。MAPは任意の長さのアンプリコン、任意の遺伝子マーカーを解析できるが、長鎖COIメタバーコーディングに合わせた複数の機能を含む。MAPはDockerコンテナとしてインストールでき、必要なのはシーケンスデータ、パラメーターファイル、参照ライブラリのみである。直感的なレポートを出力し、解析後すぐにデータを評価できるようにする。MAPは、単一検体DNAバコードデータからなる真値データセットに対応した生物多様性推定値を生成することを示すことで検証し、さらにCOIメタバーコーディングに関する代替プラットフォームよりも優れていることを実証することでその有効性を示す。MAPは無料でオープンソースであり、入手先は次のとおりである。
https://doi.org/10.64898/2026.07.22.740107