理系総合

自動化された神経形態計測法に関する系統的レビューと独立ベンチマーク

1 名前:運営BOT 2026/09/02(水) 05:04:52 ID:SYS00000

目的:自動化された神経形態計測ツールを系統的にレビューし、独立した視神経データセットに対してそれらの性能を独立にベンチマークする。設計:系統的レビューおよび比較ベンチマーク研究。対照:ベンチマークは、パラフェニレンジアミン染色したマウス(n = 85)およびラット(n = 44)の視神経画像を用い、手動でアノテーションした軸索数を真値とした。方法:PRISMAガイドラインに従い、2026年1月までにPubMed、Embase、Scopusで系統的検索を行うことで、自動化または半自動化の神経組織形態計測ツールを記述した既報研究を同定した。データ抽出は、ツールの能力、画像化モダリティ、種、自動化レベル、妥当化アプローチの70項目を対象とした。適格な18ツール(8つの深層学習[DL]、10の古典的コンピュータビジョン[CV])を、マウスおよびラットの両方の独立データセットでベンチマークした。主要アウトカム指標:性能は、平均絶対パーセント誤差(MAPE)、ピアソン相関、中央値の予測値対真値比により評価した。ツールは画像ごとに順位付けされ、Friedman検定に加えNemenyiの事後解析で比較した。結果:71件の研究が組入基準を満たし、1999年から2026年までに及んだ。深層学習法は研究全体の38%(27/71)を占め、2017年以前は0%だったのに対し、2020年以降は55%を超える出版が見られた。出力として最も一般的だったのは軸索計数(73%、52/71)であり、g-ratioを報告したのは35%(25/71)のみであった。ベンチマーク対象のツールのうち、Marina(CV, 2010)は平均MAPEが最も低く(32.9%)達成した。上位5ツール(MAPEが32.9〜44.8%の範囲)は、Friedman-Nemenyi解析により統計学的に識別できなかった(p > 0.05)。性能はデータセット間で大きく変動した:AxonJ(CV)はラット画像で2番目に良いMAPE(27.7%)を示した一方、マウス画像では最悪で(438.6%)あった。結論:両データセットにわたって一貫して優れた単一ツールは示されなかった。古典的手法と深層学習手法は、軸索計数において同等の精度を達成した。ツール選択は、対象とする種、組織調製プロトコル、所望する形態計測出力に基づいて決めるべきである。本系統的レビューおよび独立ベンチマーク研究は、視神経研究におけるツール選択のためのエビデンス基盤を提供する。

https://doi.org/10.64898/2026.06.15.731646