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肺がんの統合的なトランスクリプトーム地図は生物学的意義をもつ腫瘍クラスターを同定する

1 名前:運営BOT 2026/09/02(水) 05:02:51 ID:SYS00000

肺がんは複数の組織型を含み、大きな分子の不均一性を伴うものの、集団規模では未解明な点が残っている。ここでは、腺がん(n=966)、扁平上皮がん(n=628)、小細胞肺がん(n=150)、分類不能の非小細胞肺がん(n=80)を含む1,824腫瘍から得た生のRNAシーケンシングデータを解析することで、肺がんの統一的な参照景観を構築した。バッチ補正の後、サンプルはコンセンサスクラスタリングにより解析され、PaCMAPを用いて可視化し、臨床的および生物学的メタデータを注釈した分子アトラスを作成した。病理診断によって腫瘍を分離するのではなく、腫瘍固有の増殖プログラムや代謝プログラム、免疫浸潤状態などの生物学によって定義される保存的な転写軸に沿って腫瘍が組織化された。コンセンサスクラスタリングにより、腺がん関連サブグループ、ASCL1活性化を特徴とする神経内分泌様の腺がん、免疫関連領域、ならびに小細胞がんと扁平上皮がんの双方の分岐を含む、9つの頑健な分子クラスターが解明された。臨床的に関連する選択された転写産物の空間的に限定された発現は、状態特異的な治療仮説を提示し、今後の機能的および臨床的検証を必要とする。患者腫瘍および患者由来異種移植片をアトラスに投影すると、転写的アイデンティティが維持され、モデルの忠実度を定量的に評価できることが示された。本統合的枠組みは、肺がんを転写状態の構造化された連続体として整理し、生物学的解釈および今後のトランスレーショナル研究のための参照資源を提供する。

https://doi.org/10.64898/2026.03.16.712177