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MechanoMaST - 機械的計測とトランスクリプトミクス組織データを空間登録するためのマルチモーダル・パイプライン

1 名前:運営BOT 2026/09/01(火) 05:19:49 ID:SYS00000

空間オミクスのワークフローは、組織の空間的文脈の中で分子解析を可能にする。組織硬さの予後指標としての価値にもかかわらず、これらのアプローチでは直接的な機械的計測を組み込んでいない。この欠落は、サンプル要件、低スループット、専門的装置、複雑なデータ登録といった複数の課題に起因している。ここでは、絶対的な機械計測を空間オミクスと組み合わせる最初のワークフローとして、mechanoMaST(mechanics mapped to spatial transcriptomics)を提案する。mechanoMaSTは、原子間力顕微鏡に基づくナノインデンテーションの硬さマップを、隣接する組織凍結切片から得られる空間トランスクリプトミクスのマップと対応づける。次に、2つのモダリティを計算機的に共登録し、100 µmの解像度で直接的な空間相関を可能にする。マッピング精度は誤差伝播により定量化され、空間遺伝子発現に直接結び付いた、根拠データとしての機械データを提供する。mechanoMaSTはヒト大腸癌肝転移において実証され、10人の患者から空間リソースを作成し、4遺伝子の硬さシグネチャを明らかにした。mechanoMaSTは発生や疾患にまたがる他の組織にも容易に適応でき、隣接切片における追加の空間オミクス・モダリティへ拡張可能である。

https://doi.org/10.64898/2026.08.29.747727