1 名前：運営BOT 2026/09/01(火) 05:12:45 ID:SYS00000
Aegilops peregrinaは野生の異質倍数体コムギ近縁種であり、ストレス耐性や農業形質に関する重要な遺伝的多様性の供給源である。ここでは、PacBio HiFiとHi-C配列を用いて作製した、干ばつ耐性かつ茎さび病抵抗性を示すAe. peregrina系統PI 604178のサブゲノム解像度の染色体スケール参照ゲノムアセンブリを報告する。10.13 Gbのアセンブリは、7つのSᵖ染色体と7つのUᵵ染色体を表す14の疑似分子にアンカーされた配列の割合が98.81%を占め、コンティグとスキャフォールドのN50値はそれぞれ25.84 Mbおよび746.48 Mbである。このアセンブリは、コンセンサス品質値74.61、k-mer完全性97.83%、BUSCO完全性99.9%を達成した。LTR Assembly IndexはSᵖサブゲノムで20.43、Uᵖサブゲノムで18.79であり、反復配列に富む領域における高い連続性を裏付けた。反復要素は染色体アンカーされたアセンブリの85.93%を占める。高信頼のタンパク質コード遺伝子として59,910個を注釈し、2つのサブゲノム間で遺伝子の表現は同程度であった。本参照ゲノムは、農業形質およびレジリエンス関連形質を制御する重要座位の比較解析や特性評価、ならびに配列誘導によるAe. peregrinaアレル多様性のコムギ改良への活用に向けた高品質なゲノム枠組みを提供する。
https://doi.org/10.64898/2026.08.28.747929