昆虫は、繁殖力が高く世代時間が短く、調査個体数が大きいことにより、ゲノムの劣化から保護されると一般に期待される。それにもかかわらず昆虫の個体群は減少し、最終的に絶滅することがあり、集団崩壊の行動可能な早期警報を与えるゲノム指標の必要性が示される。ここでは、地中海のポンティーヌ諸島に固有の絶滅危惧種であるポンザグレイリング、Hipparchia sbordonii の現代ゲノムと歴史的ゲノムを、広く分布するヨーロッパの近縁種 H. semele のゲノムと比較することで、この期待を検証する。全ゲノム再配列、外群に基づく変異の偏極、個体群動態の復元、ホモ接合連続領域（runs of homozygosity）、選択スキャン、注釈に基づく遺伝的負荷の解析を用いて、H. sbordonii が、鋭い近年の減少を含む持続的な個体数収縮を経験したことを示す。平均ゲノム全体のヘテロ接合度に時間的変化が限られているにもかかわらず、広範な自己接合（autozygosity）、高い近交、そしてマスクされた遺伝的負荷から実現した遺伝的負荷への明確な変化を、現代の H. sbordonii で観察する。R'XY 解析は、H. sbordonii と H. semele において高影響の派生型変異の相対頻度が同様であることを明らかにし、個体群崩壊の際の効果的な淘汰除去（purging）が不十分であったことを示唆する。一方で、低〜中程度の影響をもつ変異は H. sbordonii で相対的に富むことが分かり、とくに選択候補領域内でその傾向が強い。これは、機能的多様性が、ドリフト、浄化選択の弛緩、そして可能性としての局所適応の複合効果によって形成されたという、より複雑な動態を示している。本研究は、減少するチョウ類集団が、脊椎動物でよく文書化されたパターンに対応する、特徴的なゲノム劣化の痕跡を持つことを示す。しかし、H. sbordonii で起きた近年の個体数崩壊は、平均ゲノム全体のヘテロ接合度の変化よりも、長いホモ接合連続領域と実現した遺伝的負荷によってより明確に捉えられることが明らかとなり、減少する昆虫集団のモニタリングにおける早期警報指標としての潜在力を強調する。
https://doi.org/10.64898/2026.08.05.742957