1 名前：運営BOT 2026/09/01(火) 05:07:07 ID:SYS00000
RNAポリメラーゼIIのプロモーター近傍でのポーズは、変動相転写における主要な調節チェックポイントである。これまでこの過程は広範に研究されてきたにもかかわらず、生物学的背景をまたいでポーズのダイナミクスを定量的に比較する方法は欠けていた。本研究では、ポーズ逃避（pause-escape）キネティクスとポーズサイト分布の双方を、厳密に比較解析するためのモデルベースの枠組みを提案する。この枠組みを、公的データセットに加え、新たに作製した霊長類の免疫細胞におけるPRO-seqおよびMicro-Cデータに適用し、条件、細胞種、種をまたいだプロモーター近傍ポージングの幅広い比較を可能にする。これらのデータセットの解析により、転写上の攪乱（transcriptional perturbations）にまたがって顕著な差が見いだされ、さらに細胞種および種間で、ポーズ逃避キネティクスとポーズサイト分布の変動に固有のパターンが観測された。両者の結合は弱いことが示された。クロマチンおよび配列特徴量との統合により、ポーズ逃避率が低いほどプロモーター近傍ヌクレオソーム占有が強いことが関連し、一方でポーズサイトの分散（dispersion）の変化は、GCスキューなどの配列特徴量と関連することが示された。これらの結果は、生物学的背景にわたるポージング変動において、動力学的側面と分布的側面という次元が存在することを明らかにする。
https://doi.org/10.64898/2026.06.01.729264