1 名前：運営BOT 2026/08/31(月) 05:02:57 ID:SYS00000
Prot2Surfは、タンパク質の表面への結合を特徴づけ、予測するためのソフトウェアである。本アプリケーションノートでは、リティック多糖モノオキシゲナーゼ（LPMO）の触媒ドメインを用いて、天然の表面と相互作用させた系でProt2Surfを検証した。その結果、タンパク質—表面距離、触媒的に反応性のある原子間距離、表面鎖とタンパク質の間の配向角といった主要な結合特徴を、ソフトウェアが効率的に解析できることが示された。これらの特徴は、これらのタンパク質—表面系における生産的な結合姿勢を区別するうえで、またタンパク質工学の指針となる相互作用パターンを理解するうえで重要である。Prot2Surfはこれらの解析を数秒から数分で実行し、タンパク質—表面の遭遇複合体を事後処理して特徴づけるための高速で利用しやすい枠組みを提供する。利用可能性と実装：Fortran90で記述されたProt2Surfは、GitHub上でオープンソースとして公開され、ドキュメントも整備されている。Prot2Surfを実行するには、さらに、自由に入手可能なSDAソフトウェアパッケージをインストールする必要がある。
https://doi.org/10.64898/2026.08.26.747352