植物成長促進性細菌の内生生活性は、合成肥料や農薬への依存を減らしつつ農業生産性を高める持続可能な戦略である。本研究では、豆およびトウモロコシの根からそれぞれ分離した2つの内生細菌株R11FとR19Mに焦点を当て、ゲノム学的および機能的な特性を解析した。16S rRNA遺伝子配列、平均ヌクレオチド同一性（ANI）、ゲノム間距離計算（GGDC）に基づく比較解析により、両分離株はPseudomonas palleronianaとして分類された。比較ゲノム解析では、植物コロニー形成、リン酸溶解、ストレス適応、重金属耐性、炭化水素分解に関連する遺伝子を含む高度に保存されたゲノムが明らかになった。ゲノムマイニングによりさらに、R11FおよびR19Mからそれぞれ17および18の生合成遺伝子クラスター（BGC）が同定された。これには、ノンリボソームペプチド合成酵素（NRPS）、ピオベルジン、NRP-メタロフォア、RiPP様化合物、アリールポリエン、β-ラクトン、テルペン、NAGGN、ならびにヒドロゲンシアン化物が含まれた。R11Fでは、シリンゴマイシンおよびビスコシン生合成に関連する株特異的BGCが同定された。一方でR19Mは、アスプレニンおよびコロッシン生合成に関連するクラスターを保持していた。in vitro試験により、インドール産生、リン酸溶解、サイデロフォア産生に加え、両株が窒素無含有培地で増殖できることが確認された。さらに、両株はFusarium oxysporum、Phytophthora cinnamomi、およびColletotrichum gloeosporioidesの増殖を有意に阻害した。加えて、植物接種試験により宿主依存的な成長促進が示され、R11Fはトマト、小麦、レンズにおいて植物成長パラメータの改善が最も一貫していた。総合すると、比較ゲノミクスと実験的検証の統合により、P. palleronianaのR11FおよびR19Mが、植物成長促進、病原体抑制、耐塩ストレス、バイオレメディエーションに関連する相補的形質を有することが示された。
https://doi.org/10.64898/2026.08.28.747936