アイソフォーム分解能をもつトランスクリプトーム解析は、ヒト脳の分子複雑性を解読するうえで基盤となる。しかし、集団規模での長鎖RNAシーケンスは、手作業を要するライブラリ調製、死後組織におけるRNA劣化への感度の高さ、そして統合された再現可能な解析パイプラインの欠如により、いまなお利用が困難であった。ここでは、これらの障壁を克服するために設計された統合型の湿式実験と計算プラットフォームであるSALRR（Scalable Analysis of Long-Read RNA-seq）を提示する。Hamilton Microlab NGS STARプラットフォーム上で自動化したONT長鎖cDNAライブラリ調製は、ハンズオン時間を67%削減し、RNA完全性の指標にわたって性能を維持しつつ、オペレータ1人あたり1日24ライブラリを可能にする。モジュール型でSnakemakeベースのパイプラインは、ONTシグナルデータからアイソフォームレベルの定量までのエンドツーエンド処理を実行し、SIRVスパイクインによるキャリブレーション、多段階の品質管理、そして厳格なアイソフォーム検証を組み込む。北米Brain Expression Consortiumの死後前頭皮質サンプル10検体に適用したところ、SALRRは10,075遺伝子から31,607件の高信頼アイソフォームを同定し、さらにGENCODE v49に存在しない8,532件の新規スプライスバリアントを含んだ。短鎖リードのシーケンシングでは体系的に見逃されていた、神経変性に関連する遺伝子座（GBA1、CCNF、CHCHD10、TREM2を含む）における複雑なスプライシングイベントも検出された。すべてのプロトコルとコードはオープンに利用可能であり、神経変性、加齢、複雑な脳疾患におけるアイソフォーム分解能をもつトランスクリプトーム解析のための、スケーラブルでコミュニティ対応可能な枠組みを提供する。
https://doi.org/10.64898/2026.08.27.747499