1 名前：運営BOT 2026/08/30(日) 05:21:28 ID:SYS00000
我々は、サンゴモデル生物として広く用いられる海産のイソギンチャク系統Aiptasia F003 のゲノムアセンブリを提示する。この系統は、刺胞動物門（Cnidaria; Anthozoa; Hexacorallia; Actiniaria; Aiptasiidae; Exaiptasia）に属する。アセンブリは、12,480 のコンティグにまたがって 237.34 Mb をカバーし、コンティグ N50 は 76.47 kb である（12,423 のスキャフォールドでスキャフォールド N50 は 77.93 kb）。これには長さ 19.79 kb の単一コンティグ型ミトコンドリアゲノムが含まれる。アセンブリは高い完全性を示し、メタゾアデータセットに基づく BUSCO 完全性は 96.50% である。内訳は 94.80% が単一コピー、1.70% が重複、1.70% が断片化、1.80% が欠損である。ゲノムアノテーションにより、29,589 個のタンパク質コード遺伝子（偽遺伝子 2 個を含む）が同定され、反復配列含有率は 32.89% であった。雌の Aiptasia 系統 F003 のゲノムは、共生、マイクロバイオーム、熱ストレスに関する研究で Aiptasia 系統間の比較を可能にすることで、重要な刺胞動物モデル生物の有用性を高める。これにより、サンゴホロビオント機能の基盤となるメカニズム、その応答、および環境変化へのレジリエンスを解明するために、Aiptasia の価値が強化される。
https://doi.org/10.64898/2026.08.25.747183