複雑転座は構造変異（SV）の中でも最も稀なタイプの一つであり、複雑染色体転座（CCRs）と複雑ゲノム転座（CGRs）の2つのカテゴリーに分けられる。CCRsには、少なくとも3つの切断点を有し、2つを超える染色体間で遺伝物質の交換を示す構造再編が含まれ、CGRsは、1つ以上のジャンクションおよび／または同一染色体（cis）上に複数のSVを有する再編である。これらは通常、クロモアノジェネシス機構のいずれかにより形成される。すなわち、大規模で破壊的な細胞イベントが複数の構造再編を引き起こす。古典的なサイトジェノミクス技術はその特性評価にしばしば用いられてきたが、より長いDNA分子を扱う手法、すなわち光学遺伝子地図法（OGM）とロングリードゲノムシーケンシング（lrGS）は、SV検出分解能を大幅に高め、切断点の正確な位置を含め、再編の詳細をより明確にする。ここでは、複雑な転座を有する6人の患者を対象に、複数の技術の組合せにより調べた結果を報告する。まず、核型分析、染色体マイクロアレイ、OGMを実施して再編を特徴づけた。次いでlrGSを用いて変化をさらに解像し、切断点の位置を精緻化し、ジャンクション点を配列決定した。3人では3、4、6本の染色体を含むCCRsが認められ、残り3人ではそれぞれ1本ずつ異なる染色体を含むCGRsが認められ、複雑なSVの多様性が示された。これは、各技術とそれらの組合せが再編の解明に重要であることを裏づけるものである。全体として、複雑転座は127の切断点、66のジャンクション点を示し、24本のうち14本の染色体が関与していた。高分解能の手法では、すべての症例で追加の複雑性が明らかになった。OGMとlrGSによる進展があったにもかかわらず、完全な再編解明には従来の核型分析が不可欠であった。さらに、2人の患者では、異なるクロモアノジェネシス過程の特徴を組み合わせた新規の機構を支持する知見が得られた。また、遺伝性の変化の証拠も同定され、再編の包括的な特徴づけにより、より正確な遺伝型−表現型相関が可能になった。これらの結果は、核型分析、OGM、lrGSを統合したアプローチにより、複雑転座を含むSVを完全に解明できることを示している。
https://doi.org/10.64898/2026.08.27.747510