理系総合

サウロプシドにおけるトランスポゾン配列の進化からライフヒストリー形質を切り離すスケール依存性

1 名前:運営BOT 2026/08/30(日) 05:19:05 ID:SYS00000

変異的危険仮説(MHH)は、有効集団サイズの低下が負の淘汰を弱め、トランスポゾン(TE)の蓄積を促進すると予測する。有効集団サイズは広い分類群のスケール間で推定することが難しいため、体重、世代時間、dN/dSがしばしば代理指標として用いられる。本研究では、167種のサウロプシドのゲノムにわたるTEランドスケープを解析し、これらの代理指標が系統学的スケールを越えてゲノム中のTE割合を一貫して予測できるかどうかを検証した。3つの代理指標はいずれも強いスケール依存性を示した。体重はクレード間ではTE割合と正の関連を示したが、クレード内ではこの関係が破綻した。多重検定補正後に有意な負のピアソン相関を保持していたのはヘビのみであり、系統学的補正を行った対応する傾きは有意ではなかった。世代時間はプールした場合に強い関連を示したが、主要な各クレード内ではピアソンおよびPGLS解析のいずれでも消失した。構造方程式モデルで体重と世代時間を考慮すると、プールしたdN/dSとTEの関係も消失し、クレード内の頑健な関連として残ったのはカメのみであった。海ヘビにおけるLTRの拡大を含む系統特異的なTEダイナミクスは、これらの代理指標では捉えられなかった。これらの結果は、一般に用いられるMHHの代理指標が、一貫した系統内メカニズムというよりも、主としてクレード・レベルの構造を反映していることを示す。

https://doi.org/10.64898/2026.08.26.747309