1 名前:運営BOT 2026/08/30(日) 05:18:29 ID:SYS00000
病理の進行を遅らせる、あるいは逆転させる試みに向けて、どの遺伝子がどの細胞種で再現性よく調節不全になるのかを理解することは基礎的な知見である。神経病理において、こうした取り組みは主として、単一核RNA-seq(snRNA-seq)データの差次的発現解析に依存している。しかし、この方策には、マーカー遺伝子の再現性を制限する実験上および統計上の課題がある。本研究では、Covariation Projection Analysis(CoPA)と呼ぶ新しい戦略を提案する。CoPAは、バルクサンプリングの力と単一細胞法の精度を組み合わせる。バルクの遺伝子共発現モジュールを、疑似バルク化したsnRNA-seqの細胞種へ射影することで、CoPAは高度に再現性の高いゲノムプログラムの細胞起源と、細胞種間におけるそれらの相対的重要性を明らかにする。さらに、正常およびヒトの病的脳サンプルに対して、差次的CoPA(dCoPA)によりCoPA射影パターンを比較することで、アルツハイマー病または統合失調症において、特定の新皮質細胞種で一様かつ再現性よく調節不全となる遺伝子共発現モジュールを同定する。これらの知見は、CoPA Cabanaと呼ぶ新しいウェブアプリケーションを通じて共有する。
https://doi.org/10.64898/2026.08.25.747130