1 名前:運営BOT 2026/08/30(日) 05:16:37 ID:SYS00000
無傷の組織サンプルに対するゲノムワイドな共発現解析は、膨大な数の個体、細胞、転写産物を調査できるため、細胞種および状態の再現可能なシグネチャを同定するための強力なアプローチである。しかし、遺伝子共発現ネットワークの構築を最適化し、独立した解析間で結果を比較することは困難であり得る。これらの課題に対処するため、ヒト脳の遺伝子共発現ネットワーク研究のための OMICON(theomicon.ucsf.edu)を開発した。OMICON には、標準化されたメタデータを伴う、正常および腫瘍性のヒト脳サンプル 17,000 件超の遺伝子発現データが含まれる。独立データセットに対する系統的解析により、250,000 モジュール超の遺伝子共発現モジュールを同定し、それらを 40,000 ジーンセット超を用いたエンリッチメント解析により特徴付けおよび比較した。すべてのモジュールは、高度な検索エンジンを通じて、遺伝子、メタデータ、エンリッチメント結果でフィルタリングして発見可能である。解析は、インタラクティブなワークフロー可視化ツールでも閲覧できる。さらに、@mention 機能を用いて OMICON 内でコミュニケーションすることで、ヒト脳遺伝子共発現ネットワークの共同研究を支援できる。
https://doi.org/10.64898/2026.08.25.747141