ポリ(A)結合タンパク質核1（PABPN1）は、広く発現する核タンパク質であり、主としてポリ(A)尾部合成を促進する役割で知られている。PABPN1はスプライシング、選択的ポリアデニル化、核内RNAサーベイランスなど、RNA処理の他の複数の側面にも関与するが、これらの機能は一般に互いに独立して検討されてきた。本研究では、PABPN1の機能喪失と細胞画分分画、ならびにダイレクトRNAナノポアシーケンシングを組み合わせることで、PABPN1の異なる機能に対する区画特異性および転写産物特異性を描き出し、これらの活性が独立して働くのか、あるいは機能的に連結しているのかを明らかにすることを目的とした。我々の結果は、PABPN1枯渇が、選択的ポリアデニル化およびmRNAと長鎖ノンコーディングRNAの核から細胞質への輸送に対して、複数の転写産物特異的な影響を及ぼすことを示す。予想外にも、PABPN1欠損は数千の前駆mRNAにおけるスプライシングを増強し、細胞質におけるN6-メチルアデノシン量を変化させることが分かり、PABPN1の多面的な役割がさらに拡張されることが明らかになった。さらに、多くの遺伝子においてPABPN1枯渇は全体としてポリ(A)尾部の短縮を引き起こす一方で、他のPABPN1機能は異なる群の遺伝子に影響を与え、概ね互いに連動しない。それでもなお、これらの群のいくつかは共通の特徴を共有しており、すなわち対照細胞においてより長いポリ(A)尾部と核小体の近接性が挙げられる。総合すると、本研究は、転写後遺伝子制御におけるPABPN1の決定的な役割を明らかにし、数千のコーディングRNAおよびノンコーディングRNAのアイデンティティ、細胞内分布、ならびに存在量を形作ることを示す。
https://doi.org/10.64898/2026.08.25.747080