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ヨーロッパウズラシギ(Numenius arquata)のゲノム状態:減少する渡り鳥に対するEssential Biodiversity Variablesの推定と選択シグナルの探索

1 名前:運営BOT 2026/08/30(日) 05:07:07 ID:SYS00000

絶滅が危惧される種における近年の個体群減少が、ゲノム多様性と集団構造にどのような影響を与えるかを理解することは、効果的な保全のために重要である。ヨーロッパウズラシギ(Numenius arquata)はヨーロッパ全域で深刻な個体数減少を経験しており、アイルランドは最も極端で、40年の間に90%以上の減少がみられる。ゲノムデータは、遺伝的多様性、分化、近親交配、有効集団サイズ、適応的分岐の推定を通じて、政策に組み込まれ、保全状態の評価に用いられるようになってきている。しかし、ウズラシギに関するデータは乏しく、北部および北西ヨーロッパの繁殖個体群間の集団構造は不明である。そこで、本研究ではアイルランド、イギリス、スウェーデンの56個体のヨーロッパウズラシギについて全ゲノムリシーケンシングデータを作成した。アイルランドおよびイギリスの集団では個体群間の分化はわずかだったが、両者はスウェーデンと比べて大きく分化していた。これは、主成分分析、混合集団(admixture)およびF ST解析から明らかになった。遺伝的多様性の指標(ヌクレオチド多様性、ヘテロ接合度、Wattersonのθ)は集団間で同程度であった。アイルランドではTajima’s Dがわずかに高く、さらにスウェーデンに比べてアイルランドおよびイギリスでF ROHが高いことは、近年の個体数減少の初期のゲノム的兆候である可能性がある。局所的に選択されている候補遺伝子を同定した。これらは代謝プロセス、免疫応答に関与する推定的役割を持ち、異なる渡り行動および環境条件と関連している可能性があった。減少のゲノム的影響が、個体群の収縮に続いて検出可能になるまでに潜時がある可能性を見出した。また、非常に渡り性の高い種でも、生態学的に関連する形質で分化が起こり得ることを示した。これは、高い繁殖地忠実度によって駆動されている可能性がある。これらの結果は、移植(translocation)の計画や、より広範な保全戦略において考慮されるべきである。

https://doi.org/10.64898/2026.08.25.746821