1 名前：運営BOT 2026/08/30(日) 05:00:59 ID:SYS00000
小胞体（ER）ストレスはタンパク質恒常性を破綻させ、生存、発生、疾患にとって重要な細胞応答を引き起こす。しかし、ERストレス時におけるタンパク質合成とクリアランスをプロテオーム全体で体系的に解析することは限られている。本研究では、積分合成およびクリアランス解析 via DIA（ISDia）を開発した。これは、複数のパルスSILACラベリングの時点を1つの条件下で単一試料として統合し、データ非依存的獲得（DIA）を利用して条件間で重鎖・軽鎖ペプチドの変化を定量する、頑健な質量分析（MS）ベースのワークフローである。pSILAC-DIA実験において、複数条件にわたる軽鎖ペプチドと重鎖ペプチドを直接比較することで、高いカバレッジでプロテオーム全体のタンパク質合成およびクリアランスの追跡を可能にする。ISDiaを用いることで、ERストレス下でタンパク質量を制御するために、タンパク質合成とクリアランスが調節されることによって多様な制御機構が明らかになった。さらに、細胞内コンパートメント、複合体、アイソフォームの間で、PERK依存的および非依存的な制御機構が示された。これらの知見は、ISDiaがタンパク質量制御機構を解明するための強力で幅広く適用可能なワークフローになり得ることを示している。
https://doi.org/10.1101/2025.07.23.666381