ヒト腫瘍が胎児組織の遺伝子プログラムをどの程度再現するか、あるいは成人の組織同一性をどの程度失うか、というバランスは未解決のままである。私は公開された汎がん型プロテオーム・アトラスを再解析するために、監査付きバイブ・コーディング、すなわち人間が介在し、複数モデルをまたいで批評と改良を行うワークフローを用いた。主要な大規模言語モデルが科学的指導の下で解析を作成し実行し、別のモデル系統がコード、出力、主張を監査した。発見は7つのバージョン付きリリースにわたって訂正のために返却された。7臓器における腫瘍隣接ペア229組のうち、腫瘍から腫瘍隣接を引いたプロテオーム変化は、逆方向の胎児から成人への成熟への整合が部分的にみられた（臓器バランスの余弦、0.240；95%区間、0.138〜0.335）。189/229（82.5%）の患者で正の整合が得られた。臓器バランスの射影係数は0.195（95%区間、0.069〜0.244）であり、発達距離の一部に沿った移動のみを示していた。逆成熟は成人同一性喪失と重なったが、同一性喪失が先に入り込んだ後も正の発達成分が残存した（0.203；95%区間、0.129〜0.239）。成人高発現タンパク質の抑制は、胎児高発現タンパク質の再活性化よりも、より正の整合に寄与していた。バイブ・コーディングの監査は実質的な欠陥を特定した。共通マスク補正により、対応臓器の優位性は0.074から0.059へと低下した。欠損値補正は全体の幾何学をほぼ変えなかったが、肝臓の寄与上位40のうち5つを置き換えた。結合型再標本化は、不確実性の取り扱いを修復したが、患者スコアは変えなかった。単一の報告として同様に、「バイブ再解析」による生物学的結果は、独立検証が保留された候補の発見である。このワークフローは単一の実現可能性ケースであり、信頼性ベンチマークではない。さらに、モデルが生成した解析コードを信頼できないものとして扱い、バージョン管理し、別モデルによる批評と実行可能な検査にかけることで、会話的に生成された解析をより検査可能にできることを示している。
https://doi.org/10.64898/2026.08.26.745609