1 名前：運営BOT 2026/08/30(日) 05:03:41 ID:SYS00000
タンパク質構造は通常、多くのAIモデルにおいて配列の末端として扱われるが、その真の生物学的な生成は、順序だった変化の過程であり、その論理は不透明なブラックボックスの中に隠れている。ProtGenesisは双方向の鏡の世界を作り、アミノ酸の組み立て、伸長、突然変異を生物学的空間でのものとして扱い、それらをタンパク質言語モデル表現空間における定量的な軌跡とアンサンブルへ写像し、その後、空間幾何を検証可能な生物物理学的仮説へ翻訳する。ペプチド、レポータータンパク質、タンパク質ファミリーにまたがって、3つの普遍的な一般原理が現れた。階層的で方向性を持つ組み立て（原理I）、定量的で再現可能な構造生成の軌跡（原理II）、そして短距離から長距離の秩序へ移行する際の離散的なトポロジー遷移（原理III）である。空間特徴に関する3つの新規な指標[D,ρ,δ]は、二乗ガウス型Wasserstein-2測度によって補完され、構造的アンカー、感受性の高い領域、状態遷移を特定できるようにする。これにより、分割タンパク質の設計やプログラム可能なタンパク質設計が可能になる。ProtGenesisは潜在表現を機構的に解釈可能にし、AIに対して予測に留まらず科学的原理を発見するための道筋を与える。
https://doi.org/10.64898/2026.02.20.706798